S hypotékou je spojena celá řada poplatků. Ať už se na ni váží přímo nebo nepřímo. Ne všechny však platíte bankám, jako např. pojištění nemovitosti. Nabídky každé banky se ohledně poplatků výrazně liší a není možné proto přesně říct, jaké z nich budete muset zaplatit. 

Nejčastější poplatky s hypotékou spojené jsou: 

• poplatek za čerpání úvěru
• poplatek za schválení úvěru
• poplatek za vyhotovení znaleckého posudku nemovitosti
• pojištění nemovitosti
• poplatek za vedení úvěrového účtu
• poplatek za návrh na vklad zástavního práva na katastru nemovitostí

Právě kvůli různým poplatkům je důležité sledovat hodnotu RSPN hypotéky. Ta je skutečným ukazatelem výhodnosti hypotéky, protože zahrnuje i všechny poplatky s ní spojené. RPSN se uvádí v procentech a udává rozdíl z dlužné částky za období jednoho roku, který spotřebitel zaplatí v souvislosti se všemi výdaji spojenými s úvěrem.